Институт изначально создавался как организация, в которой концентрировались и обрабатывались материалы комплексных рыбохозяйственных экспедиций. В первые годы деятельности института на Каспийском море большие исследования проведены под руководством Н. М. Книповича. На основании этих работ в 1921 г. была опубликована монография «Гидрологические исследования на Каспийском море в 1914-1915 гг.», дающая подробное гидробиологическое описание Каспийского моря. В 1929 г. напечатана большая работа А.Я. Недошивина и В.С.Ильина "Рыболовство в водах южного Каспия". О рыболовстве на реке Урал писали В.В. Петров, М.И. Тихий и М.В. Логашев.
В 1932 г. ВНИОРХ выполнил сплошное рыбохозяйственное обследование 2745 озер Ленинградской области (в нее тогда частично входили Псковская, Новгородская и Вологодская области). В работах принимали участие гидрологи, гидробиологи, ихтиологи, специалисты по рыболовству. Л.С. Берг писал, что подобного рода кадастр в таком большом масштабе проводился в нашем государстве впервые.
К 1939 г. осуществлены рыбохозяйственные исследования на озерах: Чано-Барабинских, Ильмень, Балхаш, Псковско-Чудском, Ладожском, Онежском, Переславском, Иссык-Куль, Аральском море. Они заложили основу для развития здесь промышленного рыболовства. В кадастровых исследованиях принимали участие такие видные ученые, как П.Ф. Домрачев, Н.А.Мосевич, Б.С. Грезе, Л.С. Берг, П.А. Дрягин, О.П. Антипова, П.Н. Морозова, А.М. Шуколюков, А.П. Маркевич, Н.Д.Жуковский, И.С. Ряховский, М.К. Расцветаев.
Исследования на озерах проводили П.А. Дрягин, М.И. Тихий, И.Ф. Правдин, Н.А.Мосевич, А.И. Ефимова, А.П.Вильсон, Н.Н. Дорохина, А.Н. Пробатов, В.В. Петров, Б.С. Грезе, М.И. Маркун, Д.А. Ласточкин, А.В.Подлесный и др. На реках на севере от Коми до Печоры, Кушь, Тулока и других, на юге Чу, реке Аму-Дарья, Мургабском водохранилище, в Сибири на реке Мсина и других работали И.Ф. Правдин, В.С.Липкин, П.А.Дрягин, Л.С. Берг, В.Л. Исаченко, А.Г. Смирнов, А.А. Остроумов, П.Л. Пирожников, Е.С. Кучин, А.А. Световидова, Е.В. Чезмыевская, П.Г. Данильченко, З.Е. Тилик и т.д, При этом большое внимание уделялось изучению биологии семги и лосося. Изучением рыб в морских водоемах, т.е. на Финском заливе и в Белом море, занимались Л.С. Берг, В.С.Липкин, О.П. Антипова, К.Ф. Телегин, А.И. Рабинерсон, И.М. Герасимова, Ю.К.Петрушевский, П.Ф. Федоров, Д.Н.Талиев, П.В. Тюрин, С.В. Аверинцев и др. Они изучали сельдей, салаку, шпрота, треску, корюшек, навагу и др.
В годы Великой Отечественной войны институт был эвакуирован в г. Тобольск (1941-1944). В этот период его коллектив выполнял большую работу по изучению и освоению рыбных запасов в водоемах Сибири в целях снабжения рыбой фронта и тыла.
Используя данные рыбохозяйственных исследований предыдущих лет на Оби (П.Г. Борисов, А.И.Березовский, И.Г. Юданов, Е.В. Бурмакин, А.В. Пнев), Енисее (В.Л. Исаченко, А.И. Березовский, П.В. Тюрин, А.В.Подлесный), Пясине (П.Л. Пирожников, Н.А. Остроумов), Хатанге (В.С. Михин, Г.П. Кожевников), Лене (П.Г.Борисов, С.В. Аверинцев), Колыме и Азазее (П.А. Дрягин), институт уже в 1942 г. представил Главснабрыбпрому обоснование по дополнительному увеличению уловов рыбы в реках Сибири по районам и видам рыб в количестве до 120 тыс. т. Это привело к развитию промышленного рыболовства в водоемах Сибири.
В 1943 г. были проведены работы по изучению нельмы и сиговых рыб на больших пространствах от Витима и Олекмы на юге до опресненных районов моря Лаптевых. При этом изучались распределение, питание и пищевые отношения проходных речных и солоноватоводных рыб, миграции, нерест, возрастной состав, темп роста, численность нерестовых стад и другие вопросы. Результаты этих исследований были опубликованы П.Л.Пирожниковым. Кроме того, в годы Великой Отечественной войны были подготовлены и после ее окончания опубликованы сводки по промысловым рыбам Обь-Иртышского бассейна (П.А. Дрягин), ряд работ по биологии промысловых рыб реки Лены (П.Л. Пирожников).
По возвращении в г. Ленинград (1945 г.) институт оказал большую помощь рыбной промышленности в восстановлении рыбного хозяйства на водоемах, расположенных на территории, подвергнувшейся временной оккупации. В связи с возникшим в стране гидростроительством институт поставил вопрос и успешно добился решения о необходимости предварительного рыбохозяйственного обследования рек до строительства на них гидросооружений с целью выяснения последствий для рыбного сообщества. В результате под руководством М.И. Тихого и при участии М.В. Логашова, П.А. Дрягина, А.В. Лукина (Татарское отделение), В.Н. Жадина (ЗИН АН СССР) были обследованы такие реки, как Свирь, Мста, Волга, Кура, Риони, Терек (низовья), Дон, Молога, Шексна, Кама, Днепр и т.д., озера Онежское, Ладожское, Севан, Топоровань, Палеостом и др. При этом были поставлены вопросы о рыбохозяйственном освоении водохранилищ, их сырьевой базе, сроках хода рыбы, состоянии нерестилищ выше плотины, времени и характере ската молоди, пропуске взрослых рыб и т.д.
В 1950-60-е годы регулярные наблюдения за изменениями сырьевой базы в основных водоемах страны и исследования по биологии рыб вели П.В. Тюрин, А.И. Ефимова, А.П. Ширкова, И.С. Титенков, А.С. Смирнов, С.И.Краснощеков, А.С. Дормидонтов, П.Н. Морозова.
Основная проблема, которую решал институт в 1960-70-е годы, состояла в разработке и внедрении эффективных методов повышения рыбопродуктивности внутренних водоемов и способов управления процессами воспроизводства промысловых рыб.
В начале 1960-х годов на внутренних водоемах принимаются новые Правила рыболовства. Биологические основы правил были разработаны Петром Владимировичем Тюриным. Он разрабатывает оригинальную схему определения коэффициентов смертности и методику долгосрочного прогнозирования, которой с успехом пользуются до сих пор. Разработанная П.В. Тюриным методика сбора, первичной обработки материалов, предварительных расчетов является сейчас общепризнанной.
С конца 1960-х - в первой половине 1970-х годов озеро Ильмень становится экспериментальным водоемом, на котором разрабатываются теоретические основы регулирования рыболовства на крупных пресноводных водоемах страны, а с 1972 г. исследуется впияние нового режима рыболовства на состояние рыбных запасов озера (П.В. Тюрин, В.В. Гулин, Ю.Т. Сечин).
В связи с поставленными задачами изучалась сезонная и многолетняя динамика гидрологических, гидрохимических и гидробиологических показателей, Анализировались возрастной состав и рост основных промысловых рыб озера, условия их нереста и развития молоди, производилась оценка урожайности поколений, проводились наблюдения за развитием молоди охраняемых видов, осуществлялись сбор и обработка данных по уловам рыбы, сравнительная оценка селективных качеств промысловых орудий лова для отбора эталонных, обеспечивающих получение объективных данных по состоянию рыбных ресурсов озера. На основе анализа собранных данных осуществлялось оперативное регулирование рыболовства.
Примерно в это время В.В. Гулиным разрабатывается оригинальная методика расчета коэффициентов естественной смертности, вместе с А.И. Зоновым выпускается целый ряд работ по методам определения параметров эксплуатируемых популяций рыб, которые и сейчас являются передовыми. В этот же период проводятся исследования условий формирования продуктивности Псковско-Чудского водоема в связи с распределением и концентрацией основных промысловых рыб (Н.М. Бессонов). При этом выявлялись основные факторы, определяющие биопродуктивность и условия естественного воспроизводства промысловых рыб и колебания промысловых уловов, выявлялись наиболее продуктивные районы, причины и продолжительность их образования. По направлению рыбохозяйственного освоения водохранилищ и рек основная задача сводилась к разработке эффективных методов повышения рыбопродуктивности водохранилищ и передаче промышленности рекомендаций по их рыбохозяйственному использованию. При этом изучались кормовая база рыб, их воспроизводство, разрабатывались мероприятия по формированию ихтиофауны, определялась эффективность рыбоводно-мелиоративных и акклиматизационных работ, отрабатывались методы рационального промысла на различных водохранилищах (Г.П. Кожевников, И.Т. Негоновская, Л.Н. Шимановская, Ю.И. Никаноров, Т.К.Небольсина, А.Н. Яковлева, И.И. Лапицкий, М.Л. Пидгайко, А.К. Мохов, Т.Г. Линникова, Ф.И. Боек, Ю.Т. Сечин, И.М. Остов, А.И. Кузнецов, А.И. Романенко, К.К. Карагойшиев и многие другие).
К 1975 г. И.И. Лапицкий (руководитель) завершил комплексные биопродукционные исследования по составлению биотического баланса Цимлянского водохранилища, установив ряд важнейших закономерностей в развитии биологических процессов воспроизводства и формирования популяций рыб в водохранилищах, разработав оригинальный метод учета численности популяций рыб в Цимлянском водохранилище. На основании этого метода впервые были введены оптимальные нормы вылова, биологически обоснованы и расчитаны по кормовой базе потенциальные рыбопродуктивные возможности Цимлянского водохранилища и намечены пути значительного повышения уловов. Проведенные И.И.Лапицким и сотрудниками Волгоградского отделения исследования обобщены в монографии «Направленное формирование ихтиофауны и управление численностью популяций рыб в Цимлянском водохранилище», получившей широкую признательность у специалистов.
К 1977 г. проведено изучение биопродуктивности водохранилищ Волжского каскада для обеспечения научно обоснованного продуцирования возможных уловов (М.Л. Пидгайко), а Т.К. Небольсина и А.Н. Яковлева в 1980-х годах подготовили биотический баланс Саратовского и Волгоградского водохранилищ. Небольсиной Т.К. разработаны мероприятия по дальнейшему увеличению рыбопродуктивности Волгоградского и Саратовского водохранилищ, мелиорации естественных нерестилищ, созданию управляемых искусственных нерестилищ. За конструкцию нерестового гнезда получено авторское свидетельство на изобретение. Были разработаны рекомендации по оптимизации промысла на Волгоградском водохранилище, которые позволили значительно повысить оправдываемость прогнозов. Практическое использование этих теоретических разработок позволило разработать и внедрить Опытно-производственную Программу на Волгоградском водохранилище, что привело к 2-х кратному увеличению вылова рыбы при сохранении запасов рыб в стабильном состоянии и на достаточно высоком уровне.
В конце 1970-х годов наряду с продолжением исследований по перечисленным задачам началась разработка новых принципов регулирования промысла на волжских водохранилищах (Г. П. Кожевников), разрабатываются нормативы для любительского рыболовства на водохранилищах волжского каскада (Ю.И.Никаноров).
В 1980-х годах определяются оптимальные параметры промысловой эксплуатации запасов рыб в водохранилищах, новая стратегия промысла, разрабатываются новые правила рыболовства (В.П. Коваль, В.И.Бандура, С.В. Шибаев, Т.К. Небольсина). По результатам исследования с использованием метода математического моделирования вскрыты дальнейшие резервы для интенсификации промысла за счет внедрения тралового лова и более полного освоения запасов мелкочастиковых рыб. Показано, что новый режим не сказывается отрицательно на условиях и эффективности воспроизводства рыб.
В 1970-80-е годы выполнены большие кадастровые исследования озер Ленинградской, Псковской, Вологодской областей для оценки их сырьевых ресурсов и планирования работ по созданию озрыбхозов (С.М.Сорокин, В.В. Покровский, В.И. Белоусов, В.В. Петров-младший, А.С. Печников, В.Н. Абросов, Л.А. Жаков). Частично материалы исследований были опубликованы в трех томах Известий ГосНИОРХ (вып. 114,124,128). К 1990 г. лаборатория озерного хозяйства завершила исследования по определению оптимального уровня биопродуктивности озер для их эффективного рыбохозяйственного использования (Г.П. Руденко, А.С.Печников, В.А. Шиленко). Было выяснено влияние интенсивного промысла, осуществляемого с помощью комплекса промысловых орудий лова (невод, трал, закол, сети), на структуру и численность рыб, входящих в ихтиоценоз. Оценивалось влияние интенсивного промысла на ход биопродукционных процессов. В 1980-90-е годы на крупных озерах Северо-Запада, водохранилищах Волги, Камы, Дона и Финском заливе институт продолжал вести исследования сырьевых ресурсов и прогнозирование уловов. Эти работы стали к этому моменту традиционными.
На Финском заливе (А.Н. Смирнов, Л.В. Широков, А.Н. Попов) изучались распределение и численность основных промысловых рыб, гидрологический и гидрохимический режимы, кормовая база (зоопланктон, зообентос). Ежегодно составлялся прогноз вылова рыбы. Следует заметить, что, по статистическим данным, с 1992 г. наблюдалось значительное сокращение уловов на всех внутренних водоемах России. Это было связано с неполнотой учета добываемой рыбы и большой утечкой на сторону наиболее ценных видов рыб - судак, сиг, рипус, лещ, реализуемых помимо приемных пунктов. Это вызвано коренной ломкой социальной государственной системы, появлением большого числа заготовителей и уменьшением возможностей у контролирующих промысел организаций. Поэтому повсеместно на большинстве промысловых водоемов страны наблюдалось усиленное изъятие наиболее ценных и крупночастиковых рыб, пользующихся повышенным спросом, и недолов мелкочастиковых рыб. В результате, например, Ладожское озеро из лососево-сигового водоема постепенно преобразовалось в корюшково-сигово-мелкочастиковый водоем. Этому способствовало антропогенное эвтрофирование и загрязнение озера сточными водами промышленных предприятий и населенных пунктов.
На современном этапе по сырьевой тематике оценка запасов промысловых рыб производится в основном с использованием методов прямого учета с определением численности рыб и промыслового запаса. На основании полученных данных рассчитывается общий допустимый улов (ОДУ) основных промысловых рыб. Эти работы ведут лаборатория сырьевых ресурсов внутренних водоемов, а также все филиалы института. 
В 2012 г. Г.П. Руденко получен патент на изобретение «Способ определения общего допустимого улова рыбы». Для решения задачи производился облов исследуемого водоема разными неводами с разной интенсивностью для последующего определения численности рыб, их ихтиомассы и других продукционных показателей, необходимых для расчета ОДУ. При этом было показано с какой интенсивностью необходимо осуществлять селективный и неселективный промысел для нахождения обоснованной величины ОДУ. Способ сопоставлялся с утвержденной в 1990 г. действующей методикой, основанной на показателях ихтиомассы, пополнения и смертности рыб.
В 2014 г. в трудах ГосНИОРХ опубликовано методические пособие «Численность рыб, ихтиомасса, продукция выживших рыб и управление рыбопродукционным процессом в пресноводных водоемах» в работе в хронологическом порядке приводится обзор основных методов определения рыбных запасов и определения допустимого улова рыбы. На примере малых озер рассматриваются меры повышения рыбопродуктивности водоемов с управлением рыбопродукционным процессом. Это послужило итогом исследований и обоснованием создания научного направления – продукционная ихтиология. Помимо оценки запасов, на водоемах ведется учет числа промысловых орудий лова и рыбаков, занятых на промысле. Кроме того, сотрудники института разрабатывают рекомендации и готовят предложения по тематике, связанной с воспроизводством наиболее ценных видов рыб, запасы которых находятся в напряженном состоянии, а также биологические обоснования для внесения изменений в Правила промышленного рыболовства.
 |
 |
 |
| ТЮРИН Петр Владимирович |
СЕЧИН Юрий Трофимович |
ГУЛИН Валерий Васильевич |
 |
 |
 |
|
ЛАПИЦКИЙ |
НЕБОЛЬСИНА Татьяна Капитоновна |
ЛУКИН Александр Владимирович |
 |
 |
 |
| БЕЛОУСОВ Василий Ионович |
ПЕТРОВ Владислав Васильевич |
ПЕЧНИКОВ Александр Сергеевич |